Фамилия Сисакян — яркий пример армянской модели фамилий, где суффикс -ян (вариант -янц) означает принадлежность к роду или происхождение. Буквально Сисакян — «из рода Сисака» или «потомок Сисака». В отличие от русских фамилий с суффиксом -ов/-ев, которые часто указывают на отца (Иванов — сын Ивана), армянский -ян прикрепляется к имени или прозвищу родоначальника и передаётся без изменений по мужской линии.

Основа фамилии — Сисак. Это имя имеет два основных объяснения, и оба уходят корнями в древность. Первое и самое вероятное: Сисак — это армянское мужское имя, восходящее к названию исторической области Сисакан (Сюник) на юге современной Армении. В древнеармянских источниках Сисаком звали одного из легендарных прародителей, эпонима этой области. Второе, менее популярное объяснение: имя Сисак могло быть тюркским или персидским прозвищем, образованным от слов со значением «сорок» или «белый», но для армянской фамилии первая версия выглядит естественнее и подтверждается географической привязкой.

Интересная особенность фамилии Сисакян — её относительная редкость по сравнению с массовыми армянскими фамилиями вроде Аветисян или Петросян. Это указывает на то, что родоначальник, взявший имя Сисак, не был распространённым крестильным именем, а скорее локальным или связанным с конкретным кланом. Встречается фамилия преимущественно в Армении и в диаспоре, особенно среди потомков выходцев из Сюникской области.

Поскольку фамилия образована от имени, а не от профессии или прозвища, предки Сисакянов не были обязательно ремесленниками или воинами — они просто происходили от человека по имени Сисак. Социальный статус мог быть любым: от крестьян до князей, но само имя Сисак исторически носили представители знатных родов Сюника, что допускает аристократическое происхождение некоторых ветвей. Впрочем, без генеалогического древа для конкретной семьи это лишь предположение.