Фамилия Сиюков — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти полностью вытеснило память о крестильном имени. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не «сиять» и не «сию минуту». Основа фамилии — краткая форма одного из крестильных имён: Сила, Силуан или Сильвестр. В русской народной традиции эти имена часто сокращали до Сиюха или Сиюк, по той же модели, по которой Илья становился Илюхой, а Афанасий — Афоней. Суффикс -юк характерен для украинской и южнорусской ономастики: он указывает на сына или молодого человека. То есть Сиюк — это «маленький Сила» или «сын Силы», а Сиюков — «чей?» — принадлежащий Сиюку.

Вторая, менее вероятная, версия отсылает к тюркскому слову «сийу» — «похвала» или «восхваление». Если это так, прозвище Сиюк мог получить человек хвалебный, льстивый или, наоборот, тот, кого постоянно хвалили. Но эта гипотеза слабее: фамилия уверенно держится в русском ономастиконе, а не в тюркском, и её морфология типична для славянских фамилий на -ов.

Интересная деталь: фамилия почти не встречается за пределами России. По современным данным, основное ядро носителей сосредоточено в Поволжье и на Урале — в Самарской, Оренбургской и Челябинской областях. Это позволяет предположить, что род Сиюковых сформировался среди служилых людей или крестьян, осваивавших юго-восточные земли в XVII–XVIII веках. В переписных книгах того времени подобные фамилии нередко фиксировали именно в таких районах.

Словообразовательная модель проста: прозвище Сиюк + патронимический суффикс -ов. Суффикс -юк встречается реже, чем -ов, -ин или -ский, и придаёт фамилии отчётливый южнорусский или украинский оттенок. Поэтому среди однокоренных фамилий — Сиюхин, Сиюковский, Сиюк — именно Сиюков наиболее распространён и звучит по-русски привычно, несмотря на редкий корень.