Фамилия Скаклинев — редкий пример, где за основу взято не имя, не профессия, а прозвище, связанное с движением или характером. Корень здесь — «скакать», то есть прыгать, передвигаться скачками. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Скаклинев буквально означает «сын Скаклиня» или «из рода Скаклиня». Само прозвище Скаклиня могло звучать в двух вариантах: как «скакун» — человек быстрый, непоседливый, резкий, либо как «скакливый» — тот, кто часто скачет, суетится, не стоит на месте.

Словообразовательная модель необычна: в русских фамилиях чаще встречается основа «Скакун-» (отсюда Скакунов) или «Скачков», а форма с суффиксом «-лив-» и последующим «-ин» — редкость. Это может говорить о диалектном происхождении: в некоторых говорах «скакливый» означало «прыткий», «вертлявый», а в переносном смысле — «легкомысленный». Учитывая, что суффикс «-ин» типичен для северных и центральных областей России, можно предположить, что фамилия возникла где-то в этих регионах, возможно, в среде крестьян или посадских людей, где прозвища давались по поведению.

Версия с ремеслом маловероятна: нет ни одного промысла, связанного со скаканием или прыжками, который мог бы дать устойчивую фамилию. Зато прозвище Скаклиня могло закрепиться за человеком, который, например, работал на конюшне, часто ездил верхом, или просто за энергичным, подвижным парнем. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) аналогичные примеры — Скачков, Скакунов — трактуются именно через прозвища, без привязки к профессии. Скаклинев, вероятно, стоит в том же ряду, но с более редкой суффиксальной конструкцией.

Географически фамилия встречается крайне редко и сегодня больше известна на юге России, что могло быть результатом миграций: северное прозвище попало в казачьи или степные области, где слово «скакать» было на слуху. В любом случае, Скаклинев — не искусственная фамилия из семинарской среды (там были бы суффиксы «-ский» или «-ин» от латинских корней), а исконное народное прозвище, сохранившее живую черту предка — его быстроту и непоседливость.