Скорее всего, оно восходит к нарицательному «скиба» - «ломоть хлеба». Вероятно, так называли бедного человека, который вынужден был ограничивать себя в употреблении хлеба. Можно предположить, что основатель рода Скебер был пекарем. Кроме того, такое прозвище могло указывать на внешние особенности его обладателя: Скебером иногда называли полного, «мягкого» человека. В этом случае можно предположить, что предок обладателя фамилии Скебер был крестьянином — землепашцем. Тот факт, что однокоренные фамилии встречаются в Литве, может указывать на балтийские корни фамилии Скебер. Так, возможно, что прозвище Скебер происходит от латышского глагола skābēt - «квасить; солить). Следовательно, Скебером могли называть человека, который квасил что-либо или солил овощи. Сведения о представителях однокоренных фамилий встречаются в различных архивных документах. Так, в архивах Москвы и Красноярска встречаются литовцы Скебера Казис, сын Феликсаса, который родился в 1904 году в деревне Кайлиину Ширвинтского района Литвы, и Скеберис Вилюс Антано, рожденный в Литве.