Фамилия Склифос — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, минуя типичные русские суффиксы -ов, -ин или -ский. Она относится к так называемым «окаменевшим» формам, где исходное слово стало родовым именем, не обрастая грамматическими показателями принадлежности.

Основа фамилии — слово «склифос» или «склифоз». В русских говорах, особенно северных и сибирских, так называли человека с неприятным, скрипучим или гнусавым голосом. В словаре Владимира Даля «склифосный» означает «гнусливый, скрипучий, сиплый». Скорее всего, прозвище получил обладатель такого голоса — может, дьячок с тягучим чтением или торговец, перекрикивавший шум базара сиплым выкриком. Фамилия звучит не по-русски из-за конечного -ос, но это не греческое заимствование, а диалектное слово, которое со временем закрепилось за родом.

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с греческим «склифос» (σκλῆρος — «твёрдый, жёсткий»). Но эта гипотеза слабая: греческие фамилии в России обычно оканчивались на -пуло, -ди или -огло, а «Склифос» в таком случае остался бы без адаптации, что нетипично для массового заселения. К тому же, носители фамилии встречаются в основном в центральной России, а не в местах греческих диаспор.

Фамилия уникальна тем, что её легко спутать с известным медицинским институтом — НИИ скорой помощи имени Склифосовского. Но общего корня нет: фамилия знаменитого хирурга Николая Склифосовского образована от топонима Склифос (вероятно, местечко в Молдавии), а «Склифос» — от прозвища по голосу. Это разные фамилии, которые случайно созвучны.

Встречается фамилия редко, в основном в документах XIX века из Тверской, Вологодской и Архангельской губерний. Носители — чаще крестьяне или мещане, что подтверждает бытовое происхождение прозвища. Сегодня фамилия сохранилась у нескольких семей, и её обладатели, скорее всего, потомки того самого «склифосного» человека с характерным говором.