Фамилия Скомароха — один из тех редких случаев, когда прозвище сохранилось в почти неизменном виде, без типичных фамильных суффиксов -ов или -ин. Перед нами чистая основа, которая застыла в роли фамилии. Такое оформление встречается в основном у украинских, белорусских и южнорусских фамилий, где усечённая форма была нормой: Скомароха стоит в одном ряду с Паливода, Нетудихата или Кривонос.

Корень здесь прозрачен — «скоморох». В древнерусском языке скоморохами называли бродячих актёров, музыкантов, певцов и плясунов, которые развлекали народ на ярмарках и пирах. Человек с таким прозвищем мог быть либо профессиональным потешником, либо получить его за весёлый нрав, склонность к шуткам и балагурству. В некоторых говорах слово приобрело ироничный или даже бранный оттенок — так могли назвать несерьёзного, легкомысленного человека.

Интересно, что фамилия сохранила древнюю форму на -а, характерную для украинского и белорусского произношения. В русских землях скоморохов часто называли «скомарох» (с ударением на последний слог), а фамилии образовывали как Скомарохов. Вариант без суффикса — Скомароха — указывает на то, что предок носителя, скорее всего, жил на территории современной Украины или Беларуси, где такие прозвища напрямую переходили в фамилии без дополнительного оформления.

В ономастических источниках фамилия не получила широкого распространения и встречается редко. Это объяснимо: профессия скомороха не была наследственной, а церковь и государство в XVII веке активно преследовали скоморошество как языческое и «бесовское» занятие. Поэтому прозвище, скорее всего, давалось не по ремеслу отца к сыну, а за личную черту характера конкретного человека — за шумный нрав или любовь к песням и пляскам.