Фамилия Скомарцев происходит от прозвища Скомарь. В основе — диалектное слово «скомарь», которое в русских говорах означало скомороха, бродячего музыканта или плясуна. Прямая связь с древнерусскими скоморохами здесь очевидна: так могли прозвать человека весёлого нрава, участника народных игрищ или того, кто зарабатывал ремеслом потешника. Модель образования типична для восточнославянских фамилий: суффикс -ев присоединился к основе Скомарь, дав форму Скомарцев — буквально «сын Скомаря».

Интересно, что в отличие от более распространённой фамилии Скоморохов, где корень «скоморох» сохранил полную форму, в Скомарцеве произошло фонетическое стяжение. В говорах слово «скоморох» нередко сокращалось до «скомарь» — так же, как «воробей» мог превратиться в «воробь» в диалектах. Это указывает на региональное происхождение фамилии, скорее всего из северных или центральных областей России, где такие стяжения встречались чаще.

Поскольку прозвище относится к «профессиональным» — называющим род занятий — можно предположить, что первый носитель фамилии либо сам был скоморохом, либо его предок славился шутовскими выходками. В социальном плане скоморохи в допетровской Руси не принадлежали к высшим сословиям, поэтому фамилия Скомарцев, скорее всего, сформировалась в крестьянской или посадской среде. Встречаются также варианты написания Скомарцов — с окончанием -ов вместо -ев, что связано с диалектным произношением, но форма на -ев считается исходной, так как основа оканчивается на мягкий согласный.

Однокоренные фамилии — Скоморохов, Скоморошников, Скомарь — подтверждают, что корень был продуктивным в разных уголках России. Однако Скомарцев отличается именно своей редкостью: в современных списках фамилий она встречается значительно реже, чем Скоморохов, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска.