Фамилия Скоморохина — женская форма фамилии Скоморохин, а та, в свою очередь, ведёт происхождение от прозвища Скоморох. В древнерусском языке скоморохом называли бродячего артиста: музыканта, плясуна, певца, акробата, нередко ещё и шута. Прозвище было не столько профессиональным, сколько характеризующим: так могли прозвать весёлого, острого на язык человека, любителя попеть и поплясать, заводилу. Однако возможен и другой вариант — прозвище могли дать человеку, который нанялся или родился в семье скомороха, то есть указывало на социальное положение.

В русской фамильной модели суффикс -ин (в женском варианте -ина) указывает на принадлежность: Скоморохин — это «сын Скомороха» или «из рода Скомороха». Такая модель типична для прозвищ и нецерковных имён, оканчивающихся на согласный или -а/-я. Интересно, что фамилия Скоморохин/Скоморохина не принадлежит к числу самых распространённых, но встречается в разных регионах России, особенно в центральных областях и Поволжье.

Стоит упомянуть, что в XVII веке, при царе Алексее Михайловиче, скоморошество на Руси подверглось гонениям: их инструменты сжигали, а самих артистов преследовали. Поэтому носители прозвища Скоморох в те времена могли испытывать определённое давление со стороны властей и церкви. Однако сама фамилия, возникнув до или после этих гонений, закрепилась и дожила до наших дней. В ономастических словарях (например, у Б. Унбегауна) эта фамилия рассматривается в ряду других, образованных от названий лиц по роду занятий или характерным чертам.

Встречается также вариант написания через «а» — Скамарохин, что связано с аканьем в произношении, но основная, литературная форма — Скоморохин. Фамилия Скоморохина — нечастая, но звучная, и её носительницы могут с полным правом связывать свою родословную с древнерусской традицией народного веселья и озорства.