Фамилия Скриганюк — яркий пример украинской модели фамильного образования. Её основа — прозвище Скриган, которое связано с диалектным глаголом «скригати» (скрипеть, визжать). В западных регионах Украины, особенно на Волыни и в Подолье, так могли назвать человека за скрипучий голос, неприятную манеру говорить или за привычку издавать резкие звуки — например, при ходьбе по скрипучему полу, работе с деревом или при игре на нехитром народном инструменте. В некоторых говорах «скрига» — это ещё и ворчун, брюзга, то есть прозвище могло отражать характер.

Суффикс -юк указывает на принадлежность: «Скриганюк» буквально значит «сын Скригана» или «потомок Скригана». Такая модель с суффиксом -ук/-юк типична для фамилий Правобережной Украины, особенно для исторических регионов Волыни, Подолья и Галичины. Это отличает фамилию от, скажем, польских аналогов на -ский или русских на -ов: здесь мы видим именно украинскую патронимическую традицию, где фамилия закрепилась за целым родом от одного прозвища.

Менее вероятна, но допустима версия, что Скриган — это вариант фамилии от слова «скринька» (сундук, ящик) через промежуточную форму «скриган» (мастер по сундукам). Однако тогда логичнее было бы ожидать форму Скринькарюк или Скриньковский. Прозвище от скрипа — более естественное и распространённое объяснение, подтверждаемое живыми украинскими говорами.

Встречается фамилия и в Беларуси, но там она, скорее всего, украинского происхождения — результат миграций или смешения диалектов. Сословно предки Скриганюков были, вероятнее всего, крестьянами или мещанами: патронимические фамилии на -юк редко встречаются у шляхты. Никаких громких исторических деятелей с такой фамилией не зафиксировано, что только подтверждает её народное, бытовое происхождение.