Прозвище Скунец восходит к аналогичному нарицательному, которое в тверском диалекте означает «муравей». Скорее всего, так прозвали невысокого человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Скунец, со временем получил фамилию Скунцев.