Фамилия Слташкин — редкий и фонетически необычный случай в русской ономастике. Её основа — Слташк- — выглядит как искажённое или диалектное слово, но при ближайшем рассмотрении поддаётся расшифровке. Скорее всего, в основе лежит прозвище Слташ, образованное от глагола «слтать» — просторечной формы «слать» (посылать, отправлять). Такое прозвище могли дать гонцу, посыльному или человеку, который часто отправлял кого-то с поручениями. В некоторых говорах «слтать» означало также «суетиться, торопиться» — тогда прозвище могло относиться к непоседливому, быстрому человеку.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Слташкин буквально значит «сын Слташки» (женской формы прозвища или ласкательного варианта от Слташ). Модель образования типична для северных и центральных русских областей, где фамилии на -ин широко распространены. Однако сам корень — с чередованием гласных и стечением согласных «лт» — выдаёт возможное диалектное происхождение: в ряде говоров, особенно на северо-западе (Псковщина, Новгородчина), встречались формы вроде «слтать» вместо «слать». Это делает фамилию регионально маркированной.

Есть и альтернативная версия, менее вероятная: связь с тюркским корнем «алты» (шесть) через форму «алташ» — но для русского бытования это маловероятно, так как фамилия явно вписана в русскую словообразовательную модель с суффиксом -ин. Также не стоит путать её со случайным написанием фамилии Солташкин (от «солташ» — диалектного названия солдата): в Слташкин отсутствует гласная после «С», что принципиально меняет этимологию.

Географически фамилия встречается единично, в основном в центральной России и Поволжье. В дореволюционных списках и переписях она не фиксируется — это говорит о том, что она могла возникнуть поздно, в XIX веке, как вариант прозвища, записанного на слух. Носители фамилии, вероятно, происходили из крестьянской или мещанской среды, где прозвища давались по занятиям или характеру.