Фамилия Смускина — женская форма, образованная от мужской Смускин. В русской традиции фамилии на -ин чаще всего отталкивались от основы, оканчивающейся на -а или -я, то есть от прозвища Смуска, которое и стало исходным. Само слово «смуска» в старых говорах означало снятую шкуру, овчину, мездру, а также невыделанную кожу. Человек мог получить такое прозвище по роду занятий: скорняк, кожевник, торговец овчинами. Встречается и переносное значение — «смуска» иногда называли худого, сморщенного или неопрятного человека, но для фамилии более вероятна профессиональная версия.

Словообразовательная модель простая: прозвище Смуска (женского рода по форме, хотя могло относиться и к мужчине) плюс притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «сын Смуски». Фамилия недворянская, типичная для крестьянской и мещанской среды, где прозвища цепко держались за род. Встречается она преимущественно в западных и центральных регионах бывшей Российской империи — особенно на территории современной Беларуси, Украины и в прилегающих областях России. Это неудивительно: там было развито овцеводство и кожевенное производство, а слово «смуска» хорошо известно в украинском и белорусском диалектах.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) Смускин прямо не разбирается, но по аналогии с фамилиями Смуров, Смуровкин, Смульский прослеживается та же основа — от названий кожи или выделки. Иногда путают со Смушковым (от «смушка» — шкурка ягнёнка), но это разные корни: смушка — уже обработанный мех, а смуска — сырьё, полуфабрикат. Так что предки носительницы фамилии Смускина, скорее всего, имели дело с выделкой кож или торговлей овчиной — ремеслом, которое в деревнях передавалось из поколения в поколение.