Фамилия Собода — редкий случай, когда основа не даёт однозначного ответа о происхождении. Сразу бросается в глаза, что это не типичная русская фамилия с суффиксом принадлежности. В ней нет ни -ов, ни -ин, ни -ский. Это чистая основа, что характерно для украинских, белорусских, польских и чешских фамилий. Поэтому искать корни стоит прежде всего в западнославянских и восточнославянских землях, а не в центральной России.

Самый прямой и очевидный вариант — связь со словом «свобода». В польском языке «wolność» — это свобода, но «soboda» в старопольских диалектах и в украинском языке означает то же самое: «свобода», «вольность». Фамилия могла возникнуть как прозвище человека вольного, независимого, либо как пожелательное имя — родители могли назвать сына Сободой, желая ему свободной жизни. В этом случае фамилия относится к группе «идеологических» прозвищ, которые давались не за внешность или ремесло, а за качество или мечту.

Вторая версия — топонимическая. В Польше, Чехии и на западе Украины есть несколько населённых пунктов с названием Собода, Соботув, Соботка. В этом случае фамилия указывает на выходца из такого места. Например, житель села Собода получал прозвище «Собода», которое затем закреплялось за его детьми. Эта версия особенно правдоподобна, если учесть, что в польской ономастике фамилии на -а без суффикса часто указывают на географическое происхождение.

Третья, менее распространённая гипотеза, отсылает к древнечешскому «sobota» — суббота. В средневековой Чехии суббота была рыночным днём, и прозвище Собода мог получить человек, родившийся или крещёный в субботу, либо торговец, чей день был связан с базаром. Однако фонетически «Собода» и «Собота» различаются, и эта версия слабее двух первых.

В русских документах фамилия Собода встречается крайне редко. Её носители в России — это, как правило, потомки переселенцев из Западной Украины, Беларуси или Польши, либо результат поздней русификации фамилии, когда первоначальное Собода утратило суффиксальное оформление. С точки зрения словообразования, это яркий пример фамилии-прозвища, которая не прошла через стандартную модель присоединения патронимического суффикса, а сохранилась в исходной форме.