Фамилия Соныгин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять её корень, нужно отбросить суффикс -ин, который в русских фамилиях чаще всего означает принадлежность: «чей?» — Соныгин, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Соняга.

Самая вероятная версия связывает основу «Сон-» с глаголом «сонить» или существительным «соня». В северных и сибирских говорах «сонить» означало дремать, клевать носом, быть в полусне. Соответственно, «соняга» — это сонливый, вялый человек, любитель поспать. Такие прозвища давали без особой злобы, скорее по заметной черте характера или привычке. Модель образования проста: прозвище Соняга (с суффиксом -яг-, типичным для прозвищ, ср. «бродяга», «работяга») плюс притяжательный суффикс -ин. Фонетически «Сонягин» со временем могло стянуться в «Соныгин» под влиянием произношения, где безударное «я» редуцируется до «и».

Менее убедительна, но возможна связь с диалектным словом «сон» в значении «пучок, связка» (например, сена) или с древним нецерковным именем Соня, которое давали ребёнку, родившемуся в сонное время суток. Однако прозвищная версия с характером человека выглядит правдоподобнее: в крестьянской среде, где ценилась работящесть, прозвище Соняга было бы очень наглядным.

Географически фамилия встречается разрозненно, но чаще в центральных и северных областях России (Вологодская, Кировская, Костромская). Это указывает на её происхождение в среде крестьян или посадских людей, где прозвища закреплялись за целыми родами.

Таким образом, предок носителя фамилии Соныгин, скорее всего, получил прозвище за свою неторопливость или любовь ко сну, и это прозвище, пройдя через века, превратилось в фамилию, утратившую первоначальный прямой смысл.