Фамилия Спаниди — яркий пример греческой фамилии, которая закрепилась в русском языке благодаря историческим связям с Причерноморьем. Её основа — греческое слово «спани́» (σπανή), что означает «редкий» или «недостаток». В греческом языке это прилагательное могло перейти в прозвище: Спано́с — «редкобородый» или «редковолосый». Именно от этой формы и образована фамилия с помощью типичного греческого патронимического суффикса -идис (-ίδης), который означает «сын» или «потомок». В русской передаче окончание часто упрощается до -и.

Таким образом, Спаниди — это «потомок Спаноса», то есть человека, которого прозвали за редкость волос или бороды. В греческой ономастике такие фамилии на -идис очень распространены, особенно в регионах, где были греческие общины: в Малой Азии, на Понте, на островах. В Российскую империю фамилия попала вместе с греческими переселенцами, которые в XVIII–XIX веках селились в Крыму, Приазовье и на юге Украины — в Мариуполе, Одессе, Таганроге. Многие из них были купцами, ремесленниками или моряками.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: корень «спан-» (от греческого «спани») + суффикс «-иди», адаптированный под русское окончание. В греческом языке ударение падает на последний слог — Спаниди́, но в русском языке часто смещается на второй слог — Спа́ниди, под влиянием привычных моделей. Встречаются и варианты написания: Спанидис, Спанидзе (последнее — уже под грузинским влиянием, так как греческие общины были и в Грузии).

Фамилия не является массовой в России, но встречается в Краснодарском крае, Ростовской области и в Крыму. Среди носителей были известные люди: например, греческий революционер и политик XIX века, но в целом фамилия остаётся локальной, связанной с греческой диаспорой. Спорных версий происхождения практически нет — этимология настолько прямая, что альтернативные гипотезы (например, от турецкого «спан» — «конюшня») не выдерживают критики, так как не объясняют суффикса.