Фамилия Спиидонов — редкий случай, когда написание сразу выдает историю. Двойное «и» в корне — не опечатка и не вариант фамилии Спиридонов. Перед нами результат народной переработки церковного имени Спиридон через стадию «Спиридонов» → «Спиридонов» с утратой «р» (явление, знакомое лингвистам как диссимиляция или гаплология) и последующим стяжением гласных. Проще говоря: предки носителя этой фамилии когда-то произносили имя Спиридон как «Спиидон», и это закрепилось в документах.

Основа — крестильное имя Спиридон, греческого происхождения, от «спиридон» — «корзиночка», «плетеная корзина». В святцах это имя носил святой Спиридон Тримифунтский, епископ IV века, почитаемый как чудотворец. В русской народной среде имя быстро обрастало вариантами: Спиридон, Спирид, Спирка, а в отдельных говорах — Спиидон, Спидон. Фамилия Спиидонов образована по стандартной модели: основа «Спиидон» + патронимический суффикс «-ов», указывающий на принадлежность к роду человека по имени Спиидон.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России, где имя Спиридон было особенно популярно, а местные говоры склонны к упрощению групп согласных. Встречается она значительно реже, чем Спиридонов, что делает её ценным маркером для генеалогического поиска: если в документах XVII–XIX веков фигурирует Спиидонов, это почти наверняка указывает на конкретную локальную ветвь, а не на случайное искажение при переписи.

Прозвищной или ремесленной версии у фамилии нет — она чисто патронимическая. Предки современных Спиидоновых были, скорее всего, крестьянами или посадскими людьми, получившими фамилию по имени отца или деда, которого в обиходе звали Спиидоном. Сословной привязки не прослеживается, но редкое написание говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где письменная фиксация была нерегулярной, а устная традиция — устойчивой.