Фамилия Стакелюн — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а балтийское или западнофинское, и это главная загадка, с которой стоит начать разбор. В русском языке фамилии с окончанием на -юн встречаются крайне редко, и чаще всего они указывают на заимствование из литовского, латышского или, реже, из эстонского языков.

По всей видимости, в основе лежит литовская или латышская фамилия Stakelionis или Stakeliūnas. В таком случае корень — stak- или stakel-, который в балтийских языках может восходить к слову «staklės» (станок, ткацкий станок) или «stakas» (стог, копна). То есть прозвище Стакелюн могло означать либо ткача, либо человека, который работал с сеном или зерном, складывая стога. Второй вариант — происхождение от личного имени Stakas, которое является краткой формой от более длинных балтийских имён, например, Станисловас.

Модель образования типична для литовских фамилий: основа + суффикс -юн- (-iūnas), который обозначает принадлежность или происхождение, часто сына или потомка. В русском языке такие фамилии приживались в основном в западных губерниях Российской империи — Виленской, Ковенской, Гродненской, а также на территории современной Беларуси. Если носитель фамилии — русский, то, скорее всего, предки были выходцами из этих мест, возможно, литовцами или белорусами, чья фамилия со временем обрусела в написании.

Версия о славянском происхождении маловероятна. В русских говорах нет слова «стакель» или «стакелюн», а суффикс -юн не характерен для русской фамильной модели (сравните с украинскими фамилиями на -юк, -юн — там другая история). Поэтому попытки связать фамилию с древнерусским «стакать» (соглашаться) или «стаккато» (музыкальный термин) — это народная этимология, не выдерживающая критики.

Таким образом, Стакелюн — это фамилия-указатель на профессию или прозвище предка, жившего в балтийском регионе. Её обладатель, скорее всего, потомок ремесленника-ткача или крестьянина, а сама фамилия — живое свидетельство миграций и смешения культур на западе Российской империи.