Фамилия Стапаненко — типичный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. Этот суффикс в украинской ономастике XVI–XVIII веков выполнял роль уменьшительно-патронимического: он указывал на «сына» или «потомка» человека, имя или прозвище которого легло в основу. В данном случае основа — Степан (через диалектное чередование «е»/«а» и редукцию гласного в безударном положении). То есть Стапаненко — это «Степанов сын», «потомок Степана».

Интересно, что написание с буквой «а» в первом слоге (Стапаненко вместо Степаненко) — не ошибка, а отражение живого произношения в южнорусских и украинских говорах. В разговорной речи имя Степан часто звучало как «Стапан», особенно в условиях аканья или под влиянием местных диалектов. Поэтому фамилия закрепилась в том виде, в каком её слышали при записи в церковных метриках или ревизских сказках.

Само имя Степан (греч. Στέφανος, «венок», «венец») пришло на Русь вместе с христианством и было широко распространено среди всех сословий. Соответственно, носители фамилии Стапаненко могли происходить из крестьян, мещан или казаков — географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, а также к югу России, где были сильны украинские переселенческие потоки.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Степаненко, Степанов, Степанюк) показывает, что Стапаненко — более редкий вариант, сохранивший именно устную, народную форму. Если Степаненко — «литературная» норма, то Стапаненко — её живой, диалектный «слепок», зафиксированный в документах. Эта фамилия — не переосмысление и не искажение, а просто другая фонетическая запись одного и того же патронима.