Фамилия Стоградский — один из тех случаев, когда корень сразу бросается в глаза, но его происхождение неочевидно. Основа «стоград» буквально переводится как «сто городов». Такое прозвище вряд ли давали человеку, который объехал сотню городов, — скорее, это метафора или народная шутка. В русских говорах «стоград» могли называть большое село, торговое место, где было много домов и улиц, или даже просто большую толпу, сборище народа. В этом смысле прозвище близко к «стоглав» или «стотысячный» — гипербола, подчёркивающая масштаб.

Суффикс -ский указывает на типично дворянский или польский способ образования фамилий, но в России он часто встречался и у духовенства, и у мещан, и у крестьян, если фамилию давали по названию места. Однако «Стоградский» — не географическая фамилия вроде «Московский» или «Тверской»: населённого пункта Стоград не зафиксировано. Значит, фамилию образовали от прозвища, и суффикс -ский здесь выполняет роль притяжательного или характеризующего: «сын Стограда» или «тот, кто из рода Стоградовых». Встречается также вариант Стоградов — с более простым суффиксом -ов, и Стоградский выглядит как его «облагороженная» форма, возможно, под влиянием моды на фамилии с -ский в XIX веке.

По сословной принадлежности Стоградские могли быть духовного звания. Семинаристам часто давали фамилии по красивым или книжным образам — «Стоградский» звучит торжественно и мог быть придуман наставником. Вторая версия — происхождение из польской или западнорусской шляхты: там фамилии на -ский были нормой, а корень «стоград» мог быть прозвищным для владельца большого имения или даже шуточным именем для человека, который хвастался своими владениями.

Встречаемость фамилии крайне низкая. По данным современных баз, Стоградские единично фиксируются в центральных областях России и в Беларуси. Найти известных носителей не удаётся — фамилия осталась редкой, не попала в дворянские родословные книги и не получила широкого распространения. Это типичный пример фамилии-уникума, где за необычным звучанием стоит либо семинарская выдумка, либо меткое деревенское прозвище, превратившееся в фамилию.