Фамилия Ступченко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках была характерна для казацкой старшины и крестьян Поднепровья. Суффикс -енко в украинской ономастике традиционно означал «сын» или «потомок», так что Ступченко — это буквально «сын Ступки» или «маленький Ступка». Основа здесь — прозвище Ступка, которое, в свою очередь, образовано от слова «ступа» — тяжёлого деревянного или каменного сосуда для толчения зерна, соли или табака.

В народной культуре прозвище Ступка могло закрепиться за человеком по разным причинам. Самая прямая — по роду занятий: предок мог быть мастером по изготовлению ступ, либо работать на толчее зерна, либо иметь мельницу-толчею. Но не менее вероятна и метафорическая версия: так могли прозвать коренастого, приземистого человека — «как ступа», то есть широкого в плечах и плотного. В украинских говорах слово «ступа» иногда употреблялось и в переносном смысле — о неуклюжем или медлительном человеке, хотя эта версия менее распространена.

Интересно, что фамилия Ступченко не имеет прямой связи с глаголом «ступать» (шагать), как может показаться на первый взгляд. В украинском языке от этого глагола образовывались фамилии с другим суффиксом — например, Ступак, Ступальский. Форма на -ченко указывает именно на уменьшительно-патронимический вариант от «Ступка», а не от «ступать».

Географически фамилия Ступченко наиболее плотно представлена в центральных и восточных областях Украины — в Черкасской, Полтавской, Киевской и Харьковской областях. В России она встречается реже, в основном в южных регионах, куда переселялись украинские крестьяне и казаки в XIX веке. По сословной принадлежности предки Ступченко могли быть как казаками, так и государственными или помещичьими крестьянами — суффикс -енко не даёт точного ответа, так как в украинской среде его носили все слои.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Ступченко стоит в одном ряду со Ступой, Ступко, Ступником и Ступаченко. Разница только в словообразовательных суффиксах: Ступка и Ступко — это прямые прозвища, а Ступаченко — ещё один вариант патронима. Таким образом, Ступченко — это не редкая, но и не массовая фамилия, сохранившая память о прозвище, связанном с бытовым предметом или внешностью предка.