Фамилия Стюпа — редкий случай, когда исходное слово почти без изменений перешло в фамилию. В её основе лежит прозвище Стюпа, а оно, в свою очередь, восходит к диалектному слову «стюпа» — так в некоторых русских говорах называли ступу. Ступа — это и тяжёлый пест для толчения, и сама ёмкость, в которой толкут зерно или соль. Прозвище могли дать человеку коренастому, приземистому, грузному — по сходству с устойчивым и массивным предметом.

Интересно, что фамилия сохранила древнюю форму без суффикса, что указывает на её относительно позднее закрепление в крестьянской среде, особенно в северных и сибирских регионах, где такие прозвища бытовали дольше. В центральной России фамилию, скорее всего, «обрусили» бы суффиксом: Стюпин (от Стюпа + -ин) или Стюпов (от Стюп + -ов). Отсутствие суффикса — признак того, что прозвище стало фамилией напрямую, без дополнительной обработки, что характерно для украинской и белорусской традиции, а также для русского Севера.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с личным именем Степан в его народной форме. В говорах имя Степан могли произносить как «Стюпан» или «Стёпа», и отсечение конечного -ан дало бы форму Стюпа. Однако это объяснение слабее: от имени Степан фамилии обычно образуются с суффиксами (Степанов, Стёпин), а чистая основа без суффикса для русского ономастикона нетипична. Прозвищная версия со ступой выглядит убедительнее.

Слово «стюпа» — диалектное, и география фамилии это подтверждает. Стюпы встречаются в основном в старых записях по Архангельской, Вологодской и Вятской губерниям, а также среди потомков переселенцев в Сибирь. В XIX веке фамилия фиксируется в метрических книгах как крестьянская, без признаков дворянского происхождения. Носители фамилии, скорее всего, были земледельцами или ремесленниками, а прозвище подчёркивало их внешность или манеру двигаться — тяжело, основательно, как ступа.

В написании фамилии возможны варианты: Стюппа (с двойной «п» — редкий случай, обычно результат ошибки писаря) и Стюпин (как уже упомянутая патронимическая форма). Современные носители фамилии Стюпа рассеяны по России, но их немного — фамилия остаётся малочисленной и хорошо сохраняет свою диалектную природу.