Фамилия Судковская — это женская форма фамилии Судковский, и её происхождение стоит искать в географическом названии или прозвище, а не в личном имени. Основа фамилии — «Судко» или «Судка», что в древнерусском языке могло быть уменьшительной формой от имени Суд (например, Судислав или Судимир) или же прозвищем, данным человеку по характеру или роду занятий. Суффикс «-овск-/-евск-» и окончание «-ий» типичны для фамилий, образованных от названий населённых пунктов (ойконимов). Таким образом, родоначальник Судковских мог быть владельцем или жителем села Судково, Судки или Судковка.

Важно отметить, что фамилии на «-ский» в среде польской и украинской шляхты, а также русского дворянства часто указывали на принадлежность к родовому поместью. Однако Судковская — не обязательно аристократическая фамилия. В XIX веке такие фамилии активно давали крестьянам и мещанам по названию деревни, откуда они происходили. Например, в исторических документах встречаются упоминания о деревнях с корнем «Суд-» на территории современных Украины, Беларуси и Польши. Наиболее вероятная версия — происхождение от топонима Судково (например, в Хмельницкой области Украины или в Витебской области Беларуси).

Есть и другой, более редкий путь: фамилия могла возникнуть от прозвища «Судко» — человека, который вершил суд, был судьёй или просто имел репутацию спорщика и правдоруба. В таком случае суффикс «-овск-» указывал бы на принадлежность потомков этому человеку («из рода Судка»). Однако эта версия менее надёжна, так как для прозвищ чаще использовали суффиксы «-ов» (Судков) или «-ин» (Судкин), а «-ский» — почти всегда признак географической привязки.

Написание фамилии через «о» в корне (Судковская) — основное и исторически сложившееся, хотя в редких случаях встречается вариант Судковская с ударением на второй слог. В любом случае, фамилия указывает на корни в западных или юго-западных регионах бывшей Речи Посполитой, где топонимы с корнем «суд-» (от слова «суд» или от имени Суд) были распространены.