Фамилия Суксин образована по самой распространённой в русском языке модели: от прозвища или имени, оканчивающегося на гласный или мягкий согласный, с помощью суффикса -ин. Вопрос в том, что легло в основу — имя, прозвище или географическое название.

Самая прямая и правдоподобная версия: основа Сукса — это форма крестильного имени Сокол или его производного Соколий. В русских говорах имя Сокол не было редкостью, а в некоторых диалектах «сукса» или «сукс» означало «сокол» (при оглушении звонкого «г» и замене «о» на «у» в безударной позиции). Такую версию поддерживает логика: фамилии от названий птиц (Соколов, Ястребов, Орлов) широко распространены. Суксин мог быть потомком человека по прозвищу Сукс или Сокол.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование: связь с финно-угорским топонимом. В Карелии и Вологодской области есть река Сукса, а также деревни с похожими названиями. Тогда Суксин — это «выходец с реки Сукса». Однако для фамилий на -ин такая географическая привязка встречается реже, чем для фамилий на -ский (Суксовский), поэтому эта гипотеза слабее.

Третья версия, которую приводят некоторые любители этимологии, — от слова «сук» (ветка). Но тогда логичнее была бы фамилия Суков или Сукин. Суффикс -ин требует основы на -а или -я, а «сук» — основа твёрдая. Поэтому эта версия натянута.

Интересная деталь: фамилия Суксин нечастотна, но встречается в основном в центральной России и Поволжье. В дореволюционных источниках её носители — преимущественно крестьяне и мещане. Никакого дворянского рода с такой фамилией не зафиксировано, что тоже говорит о её «народном» происхождении от прозвища.