Фамилия Сункишева — женская форма, мужской вариант — Сункишев. Это относительно редкая фамилия, и её происхождение напрямую связано с тюркскими языками, скорее всего, с башкирским или татарским. Основа фамилии — личное имя или прозвище Сункиш, которое в свою очередь образовано от двух корней: «сун» (или «сон») и «киш». Первая часть восходит к древнетюркскому «сон» — «последний», «конечный». Вторая — «киш» — означает «соболь», ценный пушной зверь. Таким образом, имя Сункиш могло означать «последний соболь» — возможно, так называли младшего, позднего ребёнка в семье, либо человека, родившегося в неудачный для охоты год. Есть и более прозаичная версия: в некоторых диалектах «сун» означает «копьё» или «пика», тогда прозвище могло относиться к воину или охотнику.

Суффикс -ев указывает на принадлежность: Сункишев буквально значит «сын Сункиша». Модель образования типична для русских фамилий, возникших в среде тюркских народов после вхождения их земель в состав Российского государства. В отличие от фамилий на -ин или -ов, здесь использован вариант -ев, потому что основа заканчивается на мягкий шипящий звук «ш».

Географически фамилия Сункишева чаще всего встречается в Оренбургской области, Башкортостане и Челябинской области — регионах, где исторически жили башкиры и татары. Сословно носители фамилии могли быть как рядовыми скотоводами и охотниками, так и служилыми людьми. В документах XVIII–XIX веков встречаются записи о башкирах-вотчинниках с похожими именами, но точных сведений о конкретном роде Сункишевых нет — фамилия не была широко распространена и не попала в дворянские родословные книги.

Стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к славянским корням и не связана со словом «сундук» или «сунки» — это типичная ошибка при поверхностном взгляде. Единственный надёжный путь — тюркская антропонимика, и здесь версия с именем-прозвищем Сункиш выглядит наиболее убедительной.