Фамилия Супханкулова — одна из тех, где разбор начинается не с корня, а с модели образования. Она чётко указывает на тюркское происхождение и женскую форму. Мужской вариант — Супханкулов. Суффикс -ов/-ев здесь присоединён к тюркскому составному имени, что типично для фамилий, возникших в среде татар, башкир, казахов, узбеков и других народов, оказавшихся под влиянием русской административной системы в XIX–XX веках.

Основа распадается на две части: «Супхан» и «кул». Первая, «Супхан», — это искажённое или диалектное произношение арабского «Субхан» (سبحان). В исламской традиции «Субхан» означает «пречист», «славен» — это часть формулы восхваления Аллаха (например, «Субхан Аллах» — «пречист Аллах»). Вторая часть, «кул» (qul), с тюркских языков переводится как «раб». Вместе «Супханкул» — «раб Пречистого», то есть «раб Аллаха». Это теофорное имя, распространённое у мусульманских народов: родители давали его, подчёркивая смирение перед Богом.

Интересная деталь: в отличие от более частых имён типа «Кулмухаммед» или «Кулбай», где «кул» стоит на первом месте, здесь оно оказалось в конце. При переходе в русскую фамилию ударение, скорее всего, сместилось на последний слог — Супханкулóва, хотя в оригинале имя могло звучать с ударением на первый слог (Супханкул).

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием тюрко-мусульманского населения: это Башкортостан, Татарстан, Оренбургская и Челябинская области, а также Средняя Азия. Встречается она реже, чем однокоренные «Субханкулов» или «Супхангулов» — вариант с «г» вместо «к» характерен для башкирского произношения.

Сословно предки носителя фамилии скорее всего были крестьянами или мещанами. Дворянских родов с такой фамилией в Российской империи не зафиксировано — теофорные имена с «кул» обычно давали простым людям, а не знати. Фамилия закрепилась в период массового учёта населения, когда муллы и писари записывали имена на слух, отсюда возможные колебания в написании: через «б» (Субханкулов) или через «п» (Супханкулов). Форма с «п» — более редкая и, вероятно, отражает местный говор, где звонкий «б» оглушался перед глухим «к».