Фамилия Сыдыков происходит от мужского тюркского имени Сыдык, которое восходит к арабскому корню со значением «верный, преданный, искренний, чистосердечный». Близкий вариант этого имени — Садык, и обе формы встречаются в разных тюркских языках. Родители, давая такое имя сыну, вкладывали в него пожелание, чтобы мальчик вырос человеком слова, надежным товарищем и верным другом, ведь в восточной культуре мужская дружба и верность считаются едва ли не главными добродетелями.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: к основе Сыдык добавили русский патронимический суффикс -ов, который historically закреплялся за фамилиями в среде, где русский язык служил языком делопроизводства и межнационального общения. Такую форму фамилия приобретала при документальном оформлении, поэтому сегодня она бытует в основном у народов, использующих кириллицу: казахов, киргизов, татар, башкир и других. В арабской графике или латинице это имя пишется иначе, но суффикс -ов остаётся маркером именно русскоязычной традиции оформления фамилий.

Интересно, что имя Сыдык нередко воспринималось как эпитет пророка Абу Бакра, первого праведного халифа, которого называли ас-Сиддик — «правдивейший», «подтверждающий истину». Это придавало имени дополнительный религиозный оттенок: нарекая ребёнка Сыдыком, родители не только желали ему честности, но и отсылали к авторитету одного из самых почитаемых людей в исламе. Поэтому в некоторых семьях имя могло даваться в честь деда или уважаемого религиозного наставника, а фамилия, соответственно, закрепляла память о предке, носившем это почётное именование.

Ударение в фамилии обычно падает на первый слог — Сы́дыков, хотя в разговорной речи можно услышать и вариант с ударением на второй слог. Сама фамилия не слишком распространена, но встречается в Казахстане, Кыргызстане, а также среди тюркских диаспор в России. Встречаются и родственные фамилии, образованные от того же корня: Садыков, Садиков, Сыдыкбаев, Сыдыков и другие, — что указывает на общий источник происхождения рода.