Фамилия Сысаковы — один из тех случаев, где прозвище предка оказалось прочнее и крепче, чем его крестильное имя. В основе лежит имя Сысой — русская народная форма церковного имени Сисой (от греческого «сисой» — «равный» или, по другой версии, «львиный»). В старину имя Сысой было очень распространено среди крестьян и посадских людей: оно звучало привычно, по-свойски, и быстро обросло уменьшительными формами.

Фамилия образована по простой и типичной восточнославянской модели: к основе Сысак (усечённая или ласкательная форма от Сысой) добавили патронимический суффикс -ов. Суффикс -ак в прозвищах и неканонических именах часто указывал на человека с яркой чертой или просто служил для сокращения длинного имени. Так что Сысак — это, скорее всего, «Сысой-маленький» или «Сысой, которого дома звали ласково». Сысаков, соответственно, означает «сын Сысака» или «потомок человека по прозвищу Сысак».

Интересно, что фамилия Сысаковы встречается в основном в северных и центральных областях России — в Архангельской, Вологодской, Костромской губерниях, а также на Урале. Это не случайно: именно в тех краях имя Сысой держалось дольше всего, пока в южных и западных регионах его вытеснили более модные имена. Фамилия могла возникнуть в среде государственных крестьян или посадских людей — ремесленников и торговцев, потому что дворянские роды с такой основой почти не фиксируются. Никакого особого социального статуса она не несла: Сысаковы — это люди из народа, которые получили фамилию по деду или отцу, носившему простое и тёплое прозвище.

В написании фамилии встречается путаница: иногда её записывали как Сысаков, Сысоков, а в старых переписных книгах можно найти Сысакова — с ударением на второй слог. Но корень везде один — Сысой, имя, которое сейчас почти вышло из обихода, но оставило заметный след в русских фамилиях. Рядом с Сысаковыми стоят Сысоевы, Сысовы и Сысаевы — все они потомки разных форм одного и того же имени.