Фамилия Сюсько звучит необычно, и это не случайно: её происхождение напрямую связано с диалектной лексикой северо-запада России. В основе лежит слово «сюська» — так в псковских и новгородских говорах называли свинью, поросёнка. Уменьшительно-ласкательная форма «сюська» образована от подзывного междометия «сюсь-сюсь», которым подзывают поросят. Соответственно, прозвище Сюська могли дать либо человеку с внешним сходством (полному, розовощёкому, неопрятному), либо тому, кто занимался разведением свиней. Фамилия закрепилась в форме Сюсько, что характерно для украинской и белорусской ономастики: суффикс -ко здесь указывает на уменьшительность или принадлежность, а сама модель распространена на западе и юго-западе России, в Смоленской, Брянской областях и на приграничных территориях.

География фамилии сегодня подтверждает это: основная масса носителей живёт на Украине, в западных областях (Львовская, Тернопольская, Хмельницкая), а также в Беларуси. В России Сюсько встречается редко, в основном на юго-западе, что говорит о миграции в XIX–XX веках. Интересно, что фамилия почти не имеет вариантов — написание «Сюсько» устойчиво, без удвоений или чередований, в отличие от похожих «Сюсюкин» или «Сюсин», где корень другой (от имени Сюся или глагола «сюсюкать»). Разбор суффикса -ко показывает, что фамилия могла образоваться не напрямую от прозвища, а от имени-прозвища Сюська через патронимическую модель: «чей?» — Сюськин сын, но под влиянием местного говора окончание трансформировалось в -ко.

Версия о связи с личным именем Сюся (уменьшительное от Сысой или Семён) менее правдоподобна: форма «Сюсько» плохо ложится на канонические имена, а прозвищная основа с натуралистическим значением для русских фамилий типична. Сословно носители, скорее всего, относились к крестьянам или мещанам — прозвища по бытовым, хозяйственным признакам редко встречались у дворян. Фамилия не имеет отношения к тюркским или финно-угорским корням, как может показаться из-за необычного звучания, — это чисто славянская, диалектная фамилия, сохранившая архаичное слово, которое в литературном языке почти исчезло.