Фамилия Сызоненко — яркий пример украинской модели фамилий с суффиксом -енко. Этот суффикс, самый распространённый в украинской ономастике, означал «сын» или «потомок» (как русское -ович или польское -ич). В основе фамилии лежит имя Сызон, которое является народной, разговорной формой канонического крестильного имени Сисой. Цепочка превращения проста: Сисой → Сызон (с переходом «и» в «ы» и добавлением суффикса -он, характерного для уменьшительно-ласкательных или обиходных форм) → Сызоненко, то есть «сын Сызона».

Имя Сисой (греч. Sisois) в святцах связано с несколькими христианскими подвижниками, но в народной среде оно не было таким частым, как, скажем, Иван или Пётр. Поэтому фамилия Сызоненко не относится к массовым — она встречается реже, чем, например, Иващенко или Петренко. Это придаёт ей известную уникальность: носители фамилии, скорее всего, происходят из одного или нескольких родственных гнёзд, где имя Сызон передавалось из поколения в поколение.

Географически фамилия Сызоненко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине, где суффикс -енко исторически доминировал. В России она тоже встречается, но почти всегда как след переселения украинских крестьян или казаков в XVII–XIX веках (например, на Кубань или в Слобожанщину). Интересно, что в русской среде фамилию могли «обрусить», превратив в Сызонов — так появились однокоренные, но уже великорусские варианты.

Если сравнивать с похожими фамилиями: Сызоненко стоит в одном ряду с Сызоном, Сызонюком, Сызонько. Все они образованы от одной основы, но разными суффиксами. Происхождение в обоих случаях — отчество по имени Сызон. Никаких сложных или спорных версий здесь нет: это прозрачная, «прозрачная» фамилия с ясной словообразовательной историей, без тёмных корней или заимствований.