Фамилия Таупеков образована по тюркской модели с помощью русского патронимического суффикса -ов, который в данном случае присоединен к основе Тау-пек. Разбор фамилии упирается в два ключевых слова: «тау» и «пек» (или «бек»).

Первая часть, «тау», в большинстве тюркских языков (казахском, башкирском, татарском) означает «гора». Вторая часть — «пек» — это фонетический вариант титула «бек» (князь, господин, предводитель), характерный для южнотюркских диалектов или результат оглушения согласного в русской записи. Таким образом, наиболее прямое значение фамилии — «сын горного бека» или «потомок князя гор». Однако не стоит понимать это буквально: в кочевой среде «бек» мог быть не столько правителем, сколько уважаемым главой рода, а «гора» — не обязательно географическим объектом, а прозвищем человека крепкого, несгибаемого или живущего в предгорьях.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает «тау» с арабским словом «тауба» (покаяние), которое в тюркской среде могло сократиться до «тау» в личных именах. Но в таком случае фамилия писалась бы иначе, например, Таубаков, поэтому версия с «горой» убедительнее.

Фамилия редкая, встречается преимущественно у казахов и, реже, у башкир и татар. Её география — северный Казахстан и прилегающие области России. Интересная деталь: в казахском языке есть слово «таулы» (горный, гористый), но в фамилии Таупеков использована именно конструкция «тау + пек», что указывает на составное имя или прозвище первого носителя — Тау-пек (Горный князь). Скорее всего, предок Таупековых был человеком заметным в своей общине, возможно, аксакалом или военным предводителем, которого за твердость характера или место обитания прозвали «горным беком». Русский суффикс -ов закрепил за этой основой значение «принадлежащий роду Таупека».