Фамилия Томницкий образована от названия местности Томна или от названия реки Томня. В России существует несколько населённых пунктов с названием Томна, так что не представляется возможным сказать, откуда именно был выходцем основатель рода Томницких. Река Томня протекает в Вологодской области. Предположительно её название образовано от того же корня, что и название реки Томь, - от кетского «тума» - «тёмный, чёрный».