Фамилия Топейцына — женская форма фамилии Топейцын, и её разговорное написание с буквой «ы» в суффиксе сразу даёт ключ к географии и социальному слою. Это не литературная, а народная (бытовая) форма притяжательного прилагательного. В русской ономастике фамилии на -ин и -ын образуются от основ, оканчивающихся на согласный, но в северных и северо-восточных говорах (Архангельская, Вологодская, Вятская губернии) после твёрдых согласных часто писали и произносили не «-ин», а «-ын». Фамилия Топейцын, а значит и Топейцына, скорее всего, родом именно оттуда.

Основа фамилии — слово «топейца». Это не имя и не профессия, а прозвище. Скорее всего, его дали человеку, жившему у топи — то есть у болота, трясины, топкого места. В диалектах «топь», «топейка» — синонимы болота. Суффикс -ец- в прозвище Топеец (позже упростившемся до Топейца) указывает на жителя или уроженца: топи́нец, топе́йский житель. Со временем прозвище Топейца (человек с болота) закрепилось за родом, а потом перешло в фамилию с патронимическим суффиксом -ын: «чей?» — Топейцын, то есть сын Топейцы.

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с глаголом «топить» (печь, баню). В этом случае прозвище Топейца мог получить истопник, тот, кто топит. Однако для обозначения профессии в русском языке чаще использовали суффикс -ник (топник, истопник), а не -ец, поэтому версия с болотистой местностью выглядит убедительнее.

Фамилия редкая, недворянская, крестьянского или посадского происхождения. Её носительницы — почти наверняка потомки людей, живших в глухих, лесисто-болотистых районах Русского Севера или Приуралья. Современное написание с буквой «ы» в корне (а не «и») — орфографическая примета, которая сохранила для нас живую народную речь позапрошлого века.