Фамилия Тортубекова — редкий случай, когда корень почти наверняка не славянский, а тюркский, и разобрать её стоит не по привычной модели «отчество от крестильного имени», а через географию и социальный контекст. Основа фамилии — Тортубек — состоит из двух частей: «торту» и «бек». «Бек» (или «бей») в тюркских языках означает «господин», «князь», «предводитель» — титул, который входил в состав множества имен и фамилий (например, Алибек, Тулебек). Первая часть сложнее. «Торту» может восходить к тюркскому «торт» — «четыре» (ср. казахское «торт», киргизское «төрт»), но вряд ли речь о числе. Вероятнее, это искажённое «торту» от «тору» — «закон», «обычай» (в казахском «төре» — «закон», «судья», «правитель»). В таком случае Тортубек — это «бек, соблюдающий закон» или «справедливый правитель». Есть и более бытовая версия: в некоторых тюркских диалектах «торту» означало «подарок» или «доля», тогда имя-прозвище могло означать «бек, получивший долю» или «бек как дар».

Фамилия образована с помощью русского патронимического суффикса -ов, что типично для фамилий народов Северного Кавказа, Поволжья и Средней Азии, которые входили в состав Российской империи. Суффикс -а в окончании (Тортубекова) указывает на женскую форму, но сама фамилия закрепилась за родом, а не за отдельным человеком. Носители фамилии, скорее всего, происходят из регионов, где тюркские языки соседствовали с русским административным учётом: это могут быть казахи, киргизы, башкиры или татары. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о её локальном бытовании — возможно, предки были представителями местной знати (беков) или зажиточными скотоводами, чей статус зафиксировали при переписи.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -беков, которые часто усекались до Беков или вовсе русифицировались, Тортубекова сохранила полную форму. Это может указывать на то, что род был немногочисленным и держался обособленно, не смешиваясь с соседними кланами. Спорных версий о происхождении почти нет — тюркский корень очевиден, а альтернативное славянское объяснение (от «торт» или «тортуга») лишено смысла и не подтверждается ни одним ономастическим источником. В словарях фамилия не зафиксирована, что типично для редких антропонимов окраин империи — их изучают по архивным записям и метрикам, а не по справочникам.