Фамилия Тошхужаев происходит от мужского имени Тошхужа — так в тюркской среде называли сына, которому желали стать крепким, как камень, и мудрым, как наставник. Это составное имя, и каждая его часть имела собственный смысл, который родители вкладывали в судьбу ребенка.

Основа имени — древнетюркское слово «таш», то есть «камень». В кочевой и оседлой культуре Средней Азии такое имя давали с пожеланием, чтобы мальчик рос здоровым, выносливым и несгибаемым, подобно скале. Вторая часть восходит к персидскому «ходжа» — так называли хозяина, владельца, господина, а также человека, обладающего глубокими знаниями, учителя и наставника. Соединив оба значения, получаем образ человека, который должен был сочетать физическую крепость с духовной силой и уважением в обществе.

Фамилия образована по классической русской модели притяжательных фамилий: к восточному имени Тошхужа добавили суффикс -ев, который указывал на принадлежность потомку этого человека. То есть Тошхужаев буквально означает «сын Тошхужи», «из рода Тошхужи». Такая схема — присоединение славянского суффикса к тюркскому или персидскому имени — типична для фамилий, которые складывались в регионах активного взаимодействия русских с народами Средней Азии и Поволжья.

Встречаются и варианты написания, например Ташходжаев, что связано с разной передачей первого гласного звука при переходе имени в русскоязычную среду. Оба варианта указывают на одну и ту же основу.

Точное время возникновения фамилии установить сложно. Фамилии такого типа у народов Средней Азии начали массово закрепляться в первой половине XX века, когда пошла официальная регистрация имен и фамилий в советских документах. До этого имя Тошхужа могло передаваться по наследству как родовое прозвание без твердого закрепления за семьей. Поэтому окончательно говорить о конкретном месте и годе появления фамилии можно только после глубоких генеалогических изысканий в архивах.

Однако сам факт сохранения имени-оберега в фамилии говорит о том, что предки носителей этой фамилии дорожили памятью о своем роде и теми качествами, которые когда-то хотели видеть в своем сыне.