Фамилия Тоймаков — редкий случай, когда географическая привязка перевешивает все остальные версии. Её основа — не имя и не прозвище, а название реки Тойма, притока Камы в Татарстане и Удмуртии. От неё образован топоним — село Тойма (в Елабужском районе Татарстана). Жителя этого села или выходца оттуда прозвали Тоймак, а его потомок получил фамилию Тоймаков.

Суффикс -ак в основе Тоймак — типичный для русских прозвищ, образованных от географических названий (сравните Пермяк, Сибиряк, Томчак). Модель простая: название места + -ак → прозвище жителя, затем -ов → фамилия сына или потомка. Такая схема в русской ономастике встречается реже, чем отчества от личных имён, но для Поволжья, где русские села соседствовали с финно-угорскими и тюркскими, она характерна.

Гидроним Тойма, скорее всего, финно-угорского происхождения. В марийском и удмуртском языках есть корни, близкие к «той» — река, вода. Если так, то буквальное значение фамилии — «потомок человека с реки Тоймы». Никакого личного имени Тойма в русских святцах нет, поэтому версия о крестильном имени отпадает. В тюркских языках тоже нет подходящего антропонима — основа явно местная, субстратная.

Встречаемость фамилии невысокая, основное ядро носителей — в Татарстане, Удмуртии и соседних регионах. Это подтверждает топонимическую версию: фамилия не разошлась широко, осталась в зоне исходного гидронима. Сословно предки Тоймаковых — скорее всего, государственные или экономические крестьяне, жившие в Прикамье. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Спорных версий тут практически нет. Единственная альтернатива — если Тоймак было прозвищем от диалектного глагола «тоймать» (медлить, канителить), но такой глагол не отмечен в говорах, а в ономастических словарях он не упоминается. Поэтому гидроним остаётся единственным надёжным объяснением.