Фамилия Трайковский — яркий пример того, как славянская модель образования фамилий накладывается на неславянскую основу. Её ядро — имя или прозвище Трайко, которое представляет собой южнославянскую (в первую очередь болгарскую и македонскую) форму имени Траян. Император Траян, правивший Римской империей на рубеже I–II веков, оставил заметный след на Балканах: здесь сохранились памятники, дороги, а его имя вошло в народный обиход. В болгарском и македонском языках оно сократилось до краткой, «домашней» формы Трайко, как, например, Иван превращается в Иванко.

Суффикс -ский, присоединённый к основе Трайков-, указывает на типичную для восточных славян (поляков, украинцев, белорусов) или, реже, для балканских народов модель образования фамилий по территориальному или родовому признаку. В польской традиции фамилии на -ский часто означали принадлежность к месту (например, Трайковский мог быть выходцем из села Трайково или Трайковице). В балканском варианте суффикс -ски (в русской передаче -ский) может указывать на происхождение от конкретного человека: «сын Трайко». Таким образом, Трайковский — это либо «тот, кто из рода Трайко», либо «житель поселения, названного в честь Трайко».

Географически фамилия тяготеет к двум регионам. Первый — Македония и западная Болгария, где имя Трайко до сих пор встречается как личное. Второй — Украина и юг России, куда фамилия попала с волнами переселений балканских славян (например, болгарских колонистов в Бессарабию и Приазовье в XIX веке). В русских документах фамилию могли записывать с окончанием -ий, а не -ый, что не меняет её сути.

Редкость фамилии объясняется двойной фильтрацией: исходное имя Трайко само по себе не было повсеместным, а его производная форма с суффиксом -ский в славянском мире встречается нечасто. В отличие от массовых Ивановских или Петровских, Трайковский сохраняет отчётливую балканскую «прописку» и указывает на предка, носившего античное имя, адаптированное местной речью.