Фамилия Цукерникова — женская форма фамилии Цукерников, а та, в свою очередь, образована от прозвища или профессионального имени Цукерник. Основа здесь — идишское или немецкое слово «цукер» (Zucker), то есть сахар. Суффикс -ник в славянской среде традиционно указывал на человека по роду занятий: так же, как мельник, печник или плотник. Соответственно, Цукерник — это сахарщик, торговец сахаром или владелец небольшого производства сладостей.

Фамилия относится к еврейскому ашкеназскому пласту, который активно формировался в черте оседлости Российской империи в XIX веке. В отличие от многих славянских фамилий, которые закрепились раньше, еврейские фамилии часто присваивались или выбирались по роду деятельности, месту жительства или внешним признакам. Цукерник — типичный пример «профессиональной» фамилии, которая не оставляет сомнений в том, чем занимался первый носитель.

Интересная деталь: в русском языке фамилия Цукерникова могла возникнуть двумя путями. Либо это патронимическая форма (дочь или жена Цукерника), либо, что более вероятно для позднего времени, — просто адаптация мужской фамилии Цукерников в женский вариант для документов. Суффикс -ов- здесь не указывает на принадлежность к боярскому или крестьянскому роду, как у Ивановых, а является стандартным русским окончанием для фамилий на согласный. В среде еврейского населения часто встречались параллельные формы: Цукерман (суффикс -ман, «человек») и Цукерник, что говорит о вариативности в выборе модели при переходе на русский язык.

Географически фамилия Цукерниковых тяготеет к западным губерниям — Волынской, Подольской, Киевской, а также к Бессарабии. После революции и в советское время носители расселились по крупным городам, но исторический корень остаётся связанным с местечковым бытом и мелким предпринимательством в сфере продовольствия. Других версий происхождения, например от тюркского или славянского корня, не существует — основа прозрачна и однозначна.