Фамилия Цыцерунов — редкий случай, когда имя предка читается почти без искажений, но вот с его значением всё не так прозрачно. Основа здесь — прозвище или мирское имя Цыцерун, а оно, скорее всего, восходит к глаголу «цыц» — окрику, которым заставляют замолчать или останавливают. В русских говорах «цыцнуть» означало «прикрикнуть, осадить». Человек, получивший такое прозвище, мог быть либо строгим, не терпящим возражений, либо, напротив, тем, кого постоянно одёргивали — шумным, болтливым ребёнком, которого всё время унимали. Второй вариант встречается при образовании прозвищ чаще: называли не по качеству, а по реакции окружающих.

Суффикс -ун в слове Цыцерун указывает на деятеля (ср. «бегун», «говорун», «крикун»). Значит, прозвище закрепилось за человеком, который постоянно слышал в свой адрес «цыц!». Притяжательный суффикс -ов добавился по стандартной модели: «чей сын? — Цыцерунов», то есть потомок того самого Цыцеруна. Ударение в фамилии, по логике исходного слова, падает на второй слог: Цыцеру́нов.

У фамилии есть одна любопытная особенность — редкое сочетание «цы» в начале. В русском языке это почти всегда признак заимствования (цыган, цыплёнок, цыновка) или звукоподражания. Здесь — именно второе: непосредственный звуковой жест, превратившийся в имя. Это отличает фамилию от более частых образований от канонических имён или профессий. Встречается Цыцерунов преимущественно в южнорусских и центральных областях, где говоры сохраняли это междометие в активном обиходе. Сословно фамилия однозначно крестьянская или мещанская — люди из простонародья, получившие прозвище в быту, а не в боярской среде.

Если искать параллели, то однокоренные фамилии — Цыцин, Цыкалов, Цыкнунов — все они построены вокруг того же окрика. Но Цыцерунов стоит особняком из-за суффикса -ерун, который в русской антропонимии почти не встречается. Это может быть диалектное видоизменение: в некоторых говорах «цыцеруном» называли не просто молчуна, а человека, который сам себя осаживает — заику или того, кто говорит с запинкой. Однако это лишь гипотеза без надёжных письменных подтверждений.