Фамилия Тухватуллин образована от мусульманского мужского имени Тухфатулла, которое в переводе с арабского означает «дар Аллаха». Форма Тухватулла, которая лежит в основе фамилии, может быть диалектным вариантом имени Тухфатулла. Однако фамилия Тухватуллин могла возникнуть в результате исторических изменений фамилии Тухфатуллин.