Фамилия Туксубаев — редкая, с прозрачной, но неочевидной для русского уха основой. Она образована по стандартной для многих народов России модели: к тюркскому имени или прозвищу добавили русский патронимический суффикс -ев. Разберём её по частям.

Корень «Туксубай» — это сложное тюркское имя, типичное для башкирской, татарской и казахской антропонимии. Первая часть, «тукс-», восходит к числительному «туксан» (девяносто) или к глаголу «туксу» — «насыщаться», «быть сытым», «иметь достаток». Вторая часть, «-бай», в тюркских языках означает «богач», «хозяин», «господин» и часто входила в состав имён как пожелание богатства и благополучия. Таким образом, имя Туксубай могло означать либо «девяносто богатств» (символическое пожелание множества благ), либо «сытый богач», «тот, кто имеет достаток».

Наиболее вероятная версия — числительное «туксан». В именах тюркских народов нередко встречаются числовые компоненты, обозначающие удачу или долгую жизнь (ср. Елбай — «пятьдесят богатств», Йөзбай — «сто богатств»). Число девяносто в этой традиции считалось магическим, приносящим изобилие. Поэтому Туксубай — это имя-пожелание, чтобы у человека было «девяносто видов достатка».

Фамилия Туксубаев — русская по форме, но тюркская по происхождению. Она закрепилась за потомками человека по имени Туксубай, вероятно, в среде башкир или татар, где такие сложные имена были распространены. Суффикс -ев указывает на принадлежность: «чей?» — «Туксубаев», то есть сын, внук или потомок Туксубая.

Встречается фамилия преимущественно в Башкортостане, Татарстане и в Оренбургской области — регионах, где исторически жили башкиры и татары. Носители фамилии могли быть как рядовыми скотоводами или земледельцами, так и представителями местной знати, но сословная принадлежность конкретного рода Туксубаевых по одной фамилии не определяется — она лишь указывает на имя основателя рода, которое когда-то дали с пожеланием сытой и богатой жизни.