Фамилия Туныгина — женская форма фамилии Туныгин, и её разбор стоит начать с суффикса. В русской фамильной модели суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Туныгин, то есть сын или потомок Туныги. Такая модель типична для фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а, -я.

Сложность в основе — «Туныг-». В русской ономастике слово «тун» или «туныга» не встречается в словарях как общеупотребительное. Наиболее вероятная версия связывает фамилию с диалектным глаголом «тунить» — в некоторых северных и сибирских говорах это означало «бездельничать», «шататься без дела». Тогда «туныга» — прозвище ленивого, праздного человека, которое закрепилось за родоначальником. Менее правдоподобна, но возможна связь с финно-угорскими корнями (например, «тун» — «ветер» или «сила» в коми-зырянском), но для фамилий центральной России это скорее исключение.

География фамилии Туныгина (и мужского варианта Туныгин) довольно узкая. По данным современных переписей и телефонных справочников, основная масса носителей сосредоточена в Кировской области и на Урале — в Пермском крае и Свердловской области. Это косвенно подтверждает версию о севернорусском или вятском происхождении прозвища: именно в этих регионах диалектное слово «тунить» фиксировалось этнографами.

Социальный состав предков, вероятно, был крестьянским. Фамилии на -ин в этой среде часто возникали как уличные прозвища, а позже закреплялись в документах. Никаких свидетельств о дворянском происхождении Туныгиных нет — фамилия не встречается в родословных книгах и гербовниках. По сути, перед нами типичная «прозвищная» фамилия, где за неблагозвучным для современного уха значением стоит живая народная речь: бездельника или медлительного человека в деревне прозвали Туныгой, а его дети пошли в Туныгины.