Фамилия Ундонов образована от имени Ундон, которое, предположительно, представляет собой диалектный вариант тибетского имени Ендон, означающего в переводе на русский «достоинство; добродетель; знание». Не исключено, что в основе именование Ундон восходит к монгольскому слову «ундон», которое переводится как «движение». Менее вероятно, что Ундон было прозвищем, которое восходит к названию якутского кисломолочного напитка «ундан».