Фамилия Урубаева — женская форма, мужская — Урубаев. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы прозвища или имени плюс суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих согласных). Но вот корень здесь не славянский, а тюркский, что сразу указывает на географию происхождения фамилии.

Основа «Урубай» — это сложное тюркское имя. Первая часть «ур» восходит к глаголу со значением «бить», «ударять», «колотить», а «бай» — титул богатого, знатного человека, хозяина. В буквальном смысле Урубай — «бьющий бай» или «тот, кто бьёт богача». Но в тюркской ономастике такие имена редко были прямым описанием поступка. Скорее всего, это охранительное имя-оберег: родители давали его мальчику, чтобы злые силы думали, что ребёнок им не дорог, что он «бьющий», «драчливый», а значит, не стоит его забирать. Подобные имена с глагольным корнем (например, Урусбай, Уразбай) встречаются у башкир, татар, казахов.

Следовательно, предок носителя фамилии Урубаев — человек, которого в документах или в быту записали по имени Урубай. Фамилия закрепилась в тех регионах, где было сильно влияние тюркских языков и русской административной системы: в Поволжье, на Урале, в Западной Сибири. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми из «инородцев» — например, башкирами или татарами, которые несли военную или ямскую службу. Встречаются Урубаевы и в среде сибирских татар, и у ногайцев.

Интересная деталь: в некоторых говорах «урубай» могло стать прозвищем драчуна или задиры, но это уже вторичное осмысление, когда исходное имя забылось. Однако для фамилии первичен именно антропоним — личное имя. Других версий, вроде связи с русским словом «рубать», нет: фамилия чётко держится на тюркской основе.