Фамилия Устабаева — женская форма фамилии Устабаев, и её происхождение ведёт нас в тюркскую языковую среду, скорее всего, в Среднюю Азию или Поволжье. Основа фамилии — составное имя или прозвище «Устабай», где первая часть «уста» восходит к тюркскому слову со значением «мастер», «умелец», «ремесленник» (в некоторых диалектах — «учитель» или «старший»). Вторая часть «-бай» — распространённый тюркский компонент, означающий «богатый», «господин», «хозяин». В дореволюционной ономастике «бай» часто добавляли к именам и прозвищам как почётный титул или пожелание благополучия.

Словообразовательная модель проста: к основе «Устабай» присоединили русский патронимический суффикс «-ев» (вариант «-ов» после мягких согласных), а затем добавили окончание женского рода «-а». Так фамилия вписалась в русскую грамматическую систему: мужчина — Устабаев, женщина — Устабаева. Встречается также вариант Устабай (без суффикса), что типично для казахских, узбекских или каракалпакских фамилий, которые не всегда русифицировались.

Имя Устабай могло быть дано человеку, который славился мастерством в каком-либо ремесле — кузнечном, плотницком, гончарном. Но не исключено, что это прозвище закрепилось за главой семьи или уважаемым старейшиной, которого называли «уста» в переносном смысле — как наставника. В тюркских обществах, особенно у казахов и татар, такие составные имена с «-бай» были очень популярны в XIX — начале XX века, и многие из них стали фамилиями после переписи населения и введения паспортной системы.

Спорных версий здесь немного: некоторые исследователи допускают, что «уста» может быть диалектным вариантом арабского «устад» (учитель), но это лишь уточнение, а не альтернатива. Основной смысл — «мастер-богач» или «уважаемый мастер» — остаётся устойчивым. Географически фамилия Устабаева чаще всего встречается в Казахстане, Кыргызстане, Узбекистане, а также среди татар и башкир в России. Встречаемость в русскоязычной среде — результат миграций и межэтнических браков.

Таким образом, носительница фамилии Устабаева может связывать свою родословную с человеком, которого в его общине ценили как искусного ремесленника или почтенного мастера, а суффикс «-ев» указывает на то, что фамилия оформлялась уже в рамках русской административной традиции.