Фамилия Устуянов — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычного суффикса -ов, который чаще всего присоединяется к основе на согласный. Здесь мы видим суффикс -янов, что сразу указывает на возможную восточную или, точнее, тюркскую основу. Такая модель характерна для фамилий, образованных от прозвищ или имен, оканчивающихся на -ян, -ан или -я. В русской ономастике суффикс -янов нередко встречается в фамилиях, которые возникли на стыке русской и тюркской культур, особенно в регионах Поволжья, Приуралья или Сибири, где было активно смешанное население.

Основа «Усту» почти наверняка восходит к тюркскому слову «уста» (встречается в формах «усту», «уста»). В тюркских языках «уста» означает «мастер», «умелец», «ремесленник», часто — «мастер своего дела». Это слово широко известно в Средней Азии и у татар, башкир, где «уста» могло быть и частью имени (например, Уста-бай), и прозвищем. Таким образом, Устуянов — это «сын мастера» или «потомок ремесленника». Исходное прозвище Устуян (или Устаян) дали человеку, который славился как искусный кузнец, плотник, строитель или другой умелец.

Версия о том, что фамилия могла образоваться от русского диалектного слова, маловероятна. В русских говорах нет корня «усту» с похожим значением, а попытки связать его с «устьем» или «устоем» разбиваются о грамматику: от таких основ образовались бы Устьев или Устоев, но не Устуянов. Спорных гипотез здесь немного, и самая правдоподобная — именно тюркская, подтвержденная и географией, и типичной для таких фамилий словообразовательной моделью.

Носители фамилии Устуянов встречаются нечасто, но сосредоточены в основном в Западной Сибири и на Урале — в Тюменской, Курганской областях, в Башкортостане. Это хорошо совпадает с ареалом расселения татар, башкир и других тюркоязычных народов, у которых фамилии на -янов (от основ на -ян) — обычное дело. Сословно предки Устуяновых, скорее всего, относились к государственным крестьянам или ремесленникам, а не к дворянству: фамилия не аристократическая, а профессионально-прозвищная, что типично для податных сословий.