Фамилия Усыпенко — типичный пример украинской модели образования фамилий на -енко. В украинской ономастике суффикс -енко (а также его варианты -енко, -енко) исторически означал «маленький», «сын» или «потомок» и был распространён в основном среди казачества и крестьянства Левобережной и Слободской Украины. Фамилии на -енко массово фиксируются в реестрах Войска Запорожского и в метрических книгах XVIII–XIX веков. Таким образом, предок носителя фамилии Усыпенко был, скорее всего, выходцем с территории современной Украины, а его имя или прозвище было Усыпа (или Усып).

Основа фамилии — «Усып-». Эта часть вызывает вопросы, потому что в украинском и русском языках нет распространённого имени или прозвища «Усып». Наиболее вероятное объяснение — фонетическое искажение или диалектная форма. Вероятно, основа восходит к личному имени Устин или Устим (каноническое Иустин, от латинского justus — «справедливый»). В украинских говорах звук «т» перед «и» мог смягчаться и переходить в «с»: Устим → Усым → Усыпа. Уменьшительно-ласкательная форма Усыпа (как от Ивана — Ивась, от Игната — Игнась) дала фамилию Усыпенко, то есть «сын Усыпы».

Менее вероятная, но возможная версия — от прозвища, связанного с глаголом «усыпить» (убаюкать, успокоить). Такое прозвище мог получить спокойный, медлительный человек или, наоборот, тот, кто умел усыплять бдительность. Однако эта версия слабее: прозвища от глаголов в форме повелительного наклонения (Усыпи, Усыпа) встречаются, но редко, и обычно не становятся основой для фамилий на -енко.

Фамилия Усыпенко — не самая частая, но и не редкая. Она бытует в основном в центральных и восточных областях Украины, а также среди потомков украинских переселенцев на Кубани и в Сибири. В России фамилия встречается спорадически, чаще в южных регионах. В написании иногда путают с фамилией Усипенко (от имени Устин через форму Усип), что усиливает связь с каноническим именем.

Таким образом, фамилия Усыпенко — это украинская фамилия-патроним, образованная от разговорной формы имени Устин (Устим) через суффикс -енко. Предки носителя этой фамилии, вероятно, были казаками или крестьянами из украинских земель, а само имя-основа указывает на христианскую традицию имени Иустин.