Фамилия Ваапв — один из тех редких случаев, когда написание почти полностью расходится с ожидаемой славянской моделью. В русском языке фамилии на -ов, -ев, -ин образуются от основ, которые легко читаются и членятся: Иванов, Соколов, Кузнецов. Здесь же мы видим сочетание «Ваапв», которое при беглом взгляде кажется набором букв без гласной в корне. Скорее всего, перед нами искажённая запись фамилии, возникшая при переписи или паспортизации. Исходная форма могла быть, например, Ваапов или Ваапин, но из-за неразборчивого почерка или ошибки писаря буква «о» или «и» выпала, а конечное «в» осталось. Такое встречается в документах начала XX века, когда фамилии записывали на слух, не сверяясь с правилами.

Если восстанавливать вероятную основу, то корень «Ваап» — это, скорее всего, вариант имени или прозвища. В ономастике известна фамилия Ваап, которая восходит к крестильному имени Ваап (калька с греческого «Баптист», то есть «креститель»). В русских святцах это имя встречается редко, чаще в форме Вап или Вапа. Соответственно, Ваапов — «сын Ваапа». Суффикс -ов стандартно указывает на принадлежность: чей? — Ваапов. В редких случаях возможна связь с финно-угорскими или прибалтийскими корнями, где «ваап» могло означать что-то вроде «пена» или «волна» (ср. эст. vaht), но для русской фамилии это менее вероятно.

Географически фамилия Ваапв (и её вероятные прототипы) тяготеет к северо-западу России — к регионам, где было сильное влияние новгородских и псковских говоров, а также контакты с финно-угорским населением. В метрических книгах XIX века можно найти единичные записи Вааповых в Олонецкой губернии и в Прибалтике. Социальный состав носителей — чаще крестьяне или мещане, реже духовенство (так как имя Ваап встречалось в монашеской среде).

Таким образом, современная фамилия Ваапв — это, по всей видимости, опечатка или диалектная запись, закрепившаяся в документах. Её носителям стоит искать корни в форме Ваапов, а происхождение — в редком церковном имени Ваап, которое давали в честь святого Иоанна Крестителя. Других версий, объясняющих это написание через тюркские или кавказские языки, нет — они не держатся ни на фонетике, ни на исторических данных.