Фамилия Ваапова — характерный пример крымскотатарской модели образования фамилий через притяжательный суффикс -ов/-ев. Её основа — мужское имя Ваап, которое в тюркской среде связывают со словом «vaat» — «обещание». В доисламских верованиях некоторых тюркских народов это имя могло относиться к одному из мифологических божеств, олицетворявших верность данному слову или договору. Таким образом, фамилия буквально означает «потомок (или принадлежащий) Ваапа».

Важно понимать, что у крымских татар фамилии в современном понимании закрепились поздно — в основном после присоединения Крыма к Российской империи в конце XVIII века. До этого люди обходились личным именем и указанием на отца или род. Поэтому говорить о точном времени возникновения конкретного рода Вааповых можно только после генеалогического поиска. Однако само имя Ваап — древнее, и его следы ведут вглубь тюркской мифологии, где «обещание» (vaat) было не просто бытовым понятием, а сакральным актом.

Фамилия Ваапова почти не встречается за пределами крымскотатарской среды, что делает её регионально маркированной. В отличие от многих русских фамилий на -ов, здесь суффикс присоединился не к прозвищу или профессии, а к имени с мифологическим подтекстом — это и отличает её от однокоренных фамилий вроде Ваапов (мужской вариант) или производных от арабского имени Ваххаб, с которым её иногда путают.