Фамилия Вафиади — одна из тех, что безошибочно указывает на греческое происхождение. Её основа — греческое слово «вафи» (βαφή), что означает «краска», «окрашивание» или «погружение в краску». Соответственно, Вафиадис (а в русской передаче — Вафиади) — это «красильщик», человек, занимавшийся окрашиванием тканей или кож. Фамилия образована по типичной греческой модели с суффиксом -адис (-άδης), который в русском языке часто усекается до -ади. Этот патронимический или профессиональный суффикс широко распространён в греческой ономастике, особенно среди понтийских греков.

Носители фамилии Вафиади — это, как правило, потомки греков, переселившихся на территорию Российской империи в разное время. Наиболее массовый поток пришёлся на конец XVIII — начало XX века, когда греки, спасаясь от османского гнёта, оседали в Причерноморье, Крыму, на Кубани и в южных городах России. Фамилия встречается и у греков Украины (Мариуполь, Одесса), и у греков Грузии. В русском языке написание закрепилось без окончания -с (в отличие от полной формы Вафиадис), что характерно для адаптации греческих фамилий в славянской среде.

Интересно, что в греческом языке слово «вафи» имеет и переносный смысл — «глубина», «насыщенность». Однако основная, ремесленная версия происхождения остаётся главной. Социальный статус первых Вафиади, скорее всего, был ремесленным: красильщики, владельцы мастерских, купцы, торговавшие красками и тканями. В Российской империи многие греки из ремесленников со временем переходили в купечество, поэтому среди Вафиади могли быть и зажиточные люди, но изначально фамилия «говорит» именно о профессии, а не о знатности.

В отличие от типичных русских фамилий на -ов или -ин, Вафиади не склоняется в мужском роде и склоняется в женском (у Вафиади, к Вафиади). Это ещё один маркер её иноязычного происхождения, который сразу отличает её в документах.