Фамилия Вафиева — женская форма фамилии Вафиев, и её основа восходит к арабскому женскому имени Вафия. В переводе с арабского это имя означает «выполняющая обещание; честная; выдержанная, тактичная». Родители, называя дочь Вафией, вкладывали в имя пожелание, чтобы девочка росла именно такой — верной слову и спокойной нравом.

Модель образования фамилии типична для тюркских и кавказских народов, исповедующих ислам. К имени Вафия добавили русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягкого согласного), а затем окончание -а, указывающее на принадлежность женщине. Получилась фамилия Вафиева — буквально «дочь или жена Вафия». Мужской вариант, Вафиев, строится по той же схеме, но без женского окончания.

Имя Вафия — не единственное в этом гнезде. В арабском языке есть и мужское имя Вафи (с ударением на первый слог), означающее «верный, выполняющий обещание». Поэтому фамилия Вафиев в некоторых случаях могла образоваться и от мужского имени Вафи. Однако в данном случае, с окончанием -ия, исходная форма — женское имя.

Процесс закрепления фамилий у разных народов шёл неравномерно. У татар, башкир, народов Кавказа фамилии на -ов/-ев массово оформлялись в XIX — начале XX века, часто при переписях или после введения всеобщей воинской повинности. Поэтому точное место и время возникновения рода Вафиевых можно установить только через генеалогические изыскания — например, по метрическим книгам или ревизским сказкам конкретного села.

Сегодня фамилия Вафиева встречается преимущественно в Поволжье (Татарстан, Башкортостан) и среди татарской диаспоры. Её носительницы могут и не задумываться о первоначальном значении имени, но оно по-прежнему говорит о честности и тактичности — качествах, которые ценились веками.